Bioinformātikas grupa

Bionformātikas grupas šķirklis RSU zinātnes portālā

Rīgas Stradiņa universitātes (RSU) Bioinformātikas grupa specializējas genomikas, transkriptomikas, mikrobioma un citu omikas datu analīzē un integrācijā ar epidemioloģisko, klīnisko, vides un dzīvesveida informāciju precīzijas medicīnas kontekstā, lai pielāgotu diagnostiku un terapiju indivīda vajadzībām. Grupa izmanto dažādas datu integrācijas metodes, tostarp mašīnmācīšanos un tīklu balstītas pieejas. Pašreizējās grupas aktivitātes ir vērstas arī uz pētniecības datu un programmatūras pārvaldību un kvalitāti, kā arī automatizētām skaitļošanas darbplūsmām, atbilstoši atrodamības, pieejamības, sadarbspējas un atkārtotas lietojamības (angļu val. – FAIR) principiem.

Nesen Bioinformātikas grupa paplašinājās, iekļaujot sistēmbioloģijas komandu, kuru vada Dr. sc. ing. Egils Stalidzāns. Šī komanda pēta sarežģītus bioloģiskos mehānismus, veidojot matemātiskus modeļus, kas atspoguļo sistēmas uzvedību, balstoties uz elementu mijiedarbību tajā. Viņu darbs galvenokārt ietver genoma mēroga metabolisma procesu (integrējot dažādus omikas datus) un uz fizioloģiju balstītu farmakokinētisko procesu modelēšanu, tādējādi veicinot precīzijas medicīnas pieejas attīstību.