IFN-γ saistīto gēnu ekspresijas profili kā prognostiski biomarķieri imūnterapijas efektivitātes prognozēšanai melanomas pacientu audos
Mērķis
Apraksts
Līdz ar imūnmodulējošo antivielu jeb kontrolpunktu (check point) inhibitoru ienākšanu, melonamas ārstēšanas iespējas ir būtiski uzlabojušās. Tomēr to efektivitāte pacientu vidū ievērojami atšķiras, radot nepieciešamību pēc prediktīviem biomarķieriem, lai izvēlētos katram gadījumam piemērotāko terapiju. Izmantojot gan lielapjoma, gan vienšūnu RNS sekvenēšanas (RNAseq) datus no formalīnā fiksētiem un parafīnā ieslēgtiem (FFPE) audiem, pacienti tiks stratificēti atbilstoši IFN-γ gēnu ekspresijas profilam. Šajā pētījumā tiks izmantotas divu veidu pieejas. Pirmkārt, retrospektīva ar IFN-γ saistīto gēnu novērtēšana melanomas FFPE paraugos, korelējot to ekspresiju ar terapijas iznākumu: veiksmīga (responder) vai nē (non responder). Otrkārt, ir plānots izmantot vienšūnu RNAseq, lai izprastu specifisku imūnšūnu nozīmi ar IFN-γ saistītiem gēniem, iegūstot papildus informāciju par šūnu dinamiku audzēja mikrovidē.
Projekta rezultāti
Šis projekts veicinās personalizētu pieeju melanomas pacientu ārstēšanu Latvijā, un nākotnē tā rezultātā izstrādāto diagnostiko tehnoloģiju varēs adaptēt terapijas pielāgošanai arī citu ļaundabīgo audzēju gadījumos. Starptautiskās sadarbības ietvaros šis pētījums sniegs ne vien ieguldījumu audzēju imūnoloģijas jomā, bet arī precīzijas medicīnas pilnveidošanā Rīgas Stradiņa universitātē (RSU).
