SARS-CoV-2 pīķa proteīns un cilvēka herpesvīrusa 6 un 7 reaktivācija

10 % no SARS-CoV-2 inficētajiem pacientiem pilnībā neatveseļojas no vīrusa infekcijas un tiem attīstās hroniska slimība (garais COVID). Garā COVID pacientiem nereti konstatē herpesvīrusu reaktivāciju. Nelielai grupai indivīdu attīstās līdzīgs klīniskais stāvoklis pēc SARS-CoV-2 mRNA vakcinācijas, nemaz nepiedzīvojot COVID-19. SARS-CoV-2 pīķa proteīns ir kopīgs faktors pie abu šo stāvokļu veidošanās, un to var atrast dažādos audos vairākus mēnešus pēc vīrusa infekcijas. Ir zināms, ka SARS-CoV-2 pīķa proteīns reaktivē endogēnā retrovīrusa sekvences cilvēka šūnās. Tāpēc mūsu hipotēze ir, ka SARS-CoV-2 pīķa proteīns var mijiedarboties ar saimnieka imūnsistēmas šūnu proteīniem, kas tieši maina iedzimto imunitāti un ļauj vīrusiem bieži reaktivēties. Saimniekorganisma šūnu ģenētikai un fizioloģijai potenciāli ir būtiska nozīme pīķa proteīnu mijiedarbībā. Tas arī izskaidro kāpēc tikai neliela daļa personu nelabvēlīgi reaģē uz SARS-CoV-2 infekciju vai vakcināciju. Provizoriskie eksperimentālie rezultāti apstiprina šo hipotēzi. Plānotajā projektā izmantosim uz sistēmu bioloģijas balstītas pieejas, ieskaitot starpdisciplināras metodoloģijas vienas šūnas līmenī un 3D audu modeļus, lai saprastu SARS-CoV-2 pīķa izraisīto šūnu izmaiņu un herpesvīrusu reaktivizācijas molekulāro mehānismu(s). Iegūtie rezultāti atklās būtiskas atziņas par mijiedarbību starp SARS-CoV-2 pīķa proteīnu un HHV-6 un HHV-7 reaktivāciju, iespējams, novedot pie jaunām terapeitiskām stratēģijām.

Plānotie rezultāti

• Oriģināli zinātniskie raksti, kas publicēti datubāzēs Web of Science vai SCOPUS iekļautajos Q1 vai Q2 kvartiles izdevumos – 2
• Citi anonīmi recenzēti oriģināli zinātniskie raksti citos zinātniskos žurnālos un rakstu krājumos (tostarp konferenču rakstu krājumos) ar starptautisku redakcijas kolēģiju – 2
• Zinātniskās datubāzes un datu kopas, sagatavotas atbilstīgi FAIR principiem – 2
• Cits jauns produkts vai tehnoloģija, programmatūras autortiesības (tostarp metodes, prototipi, nekomercializējamas ārstniecības un diagnostikas metodes) – 1
• Rīcībpolitikas ieteikumi un ziņojumi par rīcībpolitiku ietekmi – 1
• Iesniegts projekta pieteikums starptautiskā pētniecības un attīstības projektu konkursā (konkurss ārvalstīs vai iesniedzis starptautisks konsorcijs) – 1
• Iesniegts projekta pieteikums Latvijas pētniecības un attīstības projektu konkursā – 1

Zinātniskās grupas dalībnieki

• Bhupesh Kumar Prusty – projekta vadītājs  
• Zaiga Nora-Krūkle – galvenā izpildītāja  
• Manoj Jana – izpildītājs (studējošais)  
• Trushnal Waghmare – izpildītāja