Berlīnē norisinājās BioHackathon Europe 2025 – viens no galvenajiem ELIXIR pasākumiem

BioHackathon Europe ir viens no ELIXIR, Eiropas dzīvības zinātņu infrastruktūras bioloģiskajai informācijai konsorcija, galvenajiem pasākumiem. Tas katru gadu vienkopus pulcē bioinformātiķus un skaitļošanas bioloģijas speciālistus no visas pasaules. Intensīvā programmēšanas nedēļā dalībnieki sadarbojas dažādos inovatīvos projektos, risinot reālus izaicinājumus dzīvības zinātņu datu pārvaldībā un interpretācijā. Šis kopienas virzītais pasākums piedāvā unikālu platformu pētniekiem, lai veidotu kontaktus, apmainītos ar idejām un kopīgi izstrādātu atvērtā avotkoda risinājumus, kas veicina bioinformātikas attīstību un sniedz ieguvumus plašākai zinātniskajai sabiedrībai.

2025. gada pasākums notika no 3. līdz 7. novembrim viesnīcā Hotel Esplanade Resort Berlīnē, Vācijā, ar iespēju piedalīties attālināti tiem, kuri nevarēja ierasties klātienē.

BioHackathon ir veidots, lai veicinātu sadarbību un praktisku izstrādi, nodrošinot mērķtiecīgu darbu programmēšanas, datu integrācijas, satura veidošanas un programmatūras inženierijas jomā. Projektu tēmas tiek izvēlētas, saskaņojot tās ar ELIXIR platformu, kopienu un fokusa grupu stratēģiskajām prioritātēm, kā noteikts ELIXIR zinātniskajā programmā.

Pasākuma mērķis un galvenās tēmas

Pasākuma galvenais mērķis ir paātrināt zinātniskās inovācijas, attīstot atvērtā avotkoda pakalpojumu infrastruktūras. Galvenās uzmanības jomas ietver FAIR digitālo objektu principu (atrodami, pieejami, savietojami un atkārtoti izmantojami) ieviešanu, pastāvīgo identifikatoru izmantošanu, metadatu standartus, ontoloģijas un katalogu sistēmas. Apvienojot tehniskus ekspertus gan no ELIXIR tīkla, gan ārpus tā, BioHackathon veicina progresu kopīgo izaicinājumu risināšanā dzīvības zinātņu datu pārvaldībā.

Šā gada pasākumā tika prezentēts 31 projekts, ko atlases komisija izvēlējās, ņemot vērā to potenciālu veicināt aprēķinu rīku un pētniecības infrastruktūras attīstību. Dalība klātienē tika īpaši veicināta, lai atbalstītu ātru kopīgu risinājumu izstrādi, stiprākas kopienas saites un pieredzes apmaiņu starp dalībniekiem.

Projektā aptvertās tēmas

Projektu tēmas atspoguļoja ELIXIR misiju un stratēģiskās prioritātes, aptverot pētniecības datu pārvaldību, mācību metadatus, programmatūras savietojamību, mākslīgā intelekta izmantošanas gatavību un ar konkrētām zinātņu nozarēm saistītus izaicinājumus proteomikā, metabolomikā un bioloģiskās daudzveidības izpētē. 2025. gada iniciatīvas tematiski apvienojās piecās jomās: FAIR datu un metadatu infrastruktūras attīstība; rīku savietojamības uzlabošana; salīdzinošās analīzes darba plūsmu izstrāde omikas datiem; mašīnmācīšanās izmantošanas izpēte un kopienas virzītas izstrādes stiprināšana.

Pieejamība un ilgtermiņa ietekme

Kopš 2019. gada projektu rezultāti, tostarp avotkods, dati un dokumentācija, ir brīvi pieejami Biohackrxiv preprint platformā, nodrošinot to atkārtotu izmantošanu un tālāku attīstību zinātnes ekosistēmā. Rezultātu spektrs ietver gan praktiskus rīkus, gan baltās grāmatas (white paper) un agrīnās stadijas prototipus, no kuriem daudzi attīstās par pilnvērtīgiem resursiem, kas atbalsta datu apjomiem bagātus dzīvības zinātņu pētījumus.

Ietekmes novērtējums

Nesen veiktais ietekmes novērtējums parādīja, ka rīku kopizstrāde hakatona formātā ļauj sasniegt rezultātus 5,6 reizes ātrāk un ar trīs reizes mazākām izmaksām, salīdzinot ar tradicionālajām izstrādes metodēm. Šie dati izceļ BioHackathon modeļa efektivitāti un kolektīvās sadarbības spēku.

Papildu ieguvumi

Ne visus ieguvumus iespējams precīzi izmērīt. Pasākums kalpo arīdzan kā auglīga vide jaunu profesionālo kontaktu veidošanai, nākotnes pētniecības sadarbībām un ilgtermiņa partnerībām, kas var būtiski veicināt arī nacionālo bioinformātikas ekosistēmu attīstību – tostarp Latvijā. Neformālas sarunas un kontaktu dibināšana bieži vien kļūst par dzinējspēku jaunām iniciatīvām, projektiem un infrastruktūras komponentēm.

Pasākums veicina arī industrijas iesaisti, atbalstot komerciālo partneru dalību un veicinot sadarbību starp akadēmisko un privāto sektoru.

BioHackathon nozīmīgums

Ar katru gadu BioHackathon Europe nostiprina savu nozīmi kā platforma praktiskiem, atvērtiem un sadarbībā balstītiem risinājumiem, kas stiprina ELIXIR kopienu un veicina dzīvības zinātņu pētniecības attīstību Eiropā un ārpus tās.