Pārlekt uz galveno saturu

Eksperimentālā pētniecība Medicīniskajā ķīmijā

Studiju kursa apraksts

Kursa apraksta statuss:Apstiprināts
Kursa apraksta versija:9.00
Kursa apraksta apstiprināšanas datums:29.01.2024 10:24:10
Par studiju kursu
Kursa kods:CFUBK_025LKI līmenis:7. līmenis
Kredītpunkti:2.00ECTS:3.00
Zinātnes nozare:Ķīmija; BioķīmijaMērķauditorija:Civilā un militārā aizsardzība; Dzīvās dabas zinātnes; Ārstniecība; Bioloģija
Studiju kursa vadītājs
Kursa vadītājs:Āris Kaksis
Studiju kursa īstenotājs
Struktūrvienība:Cilvēka fizioloģijas un bioķīmijas katedra
Struktūrvienības vadītājs:
Kontaktinformācija:Rīga, Dzirciema iela 16, cfbkatrsu[pnkts]lv, +371 67061550
Studiju kursa plānojums
Pilns laiks - 1. semestris
Lekcijas (skaits)4Lekciju ilgums (akadēmiskās stundas)2Kopā lekciju kontaktstundas8
Nodarbības (skaits)8Nodarbību ilgums (akadēmiskās stundas)3Kopā nodarbību kontaktstundas24
Kopā kontaktstundas32
Studiju kursa apraksts
Priekšzināšanas:
Valodas, datorzinības un prasmes studēt internet tīmeklī (rakstiski un mutiski vidusskolas programmas apjomā); dabas zinības un matemātika: ķīmija, matemātika (algebra un ģeometrija), bioloģija, fizika.
Mērķis:
Studēt un eksperimentāli izpētīt: Olbaltumvielu, lipīdu, ogļhidrātu, un nukleīnskābju uzbūvi, sastāvu, bioķīmiskās un fizioloģiskās funkcijas cilvēka organismā.
Tēmu saraksts (pilna laika studijas)
Nr.TēmaĪstenošanas formaSkaitsNorises vieta
1Programu instalācija Jūsu datorā. Datora un FireFox3.5.5 konfigurācija molekulāro koordināšu eksperimentālai pētniecībai.Lekcijas1.00laboratorija
2Akvuaporīni šūnu membrānu šķērsojošu H2O, O2, NO transporta olbaltumvielu enzīmu klase E7 osmoze pretēji ģenerētajam koncentrācijas gradientam neatgriezeniski virzīta homeostāze cilvēka organismā.Lekcijas1.00laboratorija
3Karbo Anhidrāze CA: hidrolāzes ENZĪMS E3 klase . Primārais atraktors pH=7,36 perfektas homeostāzes funkcionāls aktivātors; neatgriezenisks CO2 saistītājs ūdenī bikarbonāta formā un masīvu kaļķakmens, dolomīta, krīta un marnora kalnu veidotājs uz planētas Zemes.Lekcijas1.00laboratorija
4O2 aqua, H+, HCO3- atspoles molekulas hemoglobīns, mioglobīns, Karbo Anhidrāze CA. Tripleta •:O≡:::≡O:• skābeklis. Skābekļa O2, CO2aqua/HCO3‑ +H+ atspoles transporta enzīmu E7+E3 klašu kompleksa mehānisms cilvēka organismā.Lekcijas1.00laboratorija
5Hēma Tyr357 koordinētas dzelzs(3+) jona Fe3+ sadursme ar deprotonētu -OOH peroksīda anjonu KATALĀZES aktiācijas enerģija ir Ea=29 kJ/mol, ģeometriskais faktors A=0,13. Nepieciešams Brauna molekulārais dzinējs neaatgriezeniskas homeostāzes instruments evolūcijai, dzīvībai un izdzīvošanai.Nodarbības1.00laboratorija
6Ciklo oksigenāze eikosanoīdu sintezātors ar singleta •::O-:-O::• skābekli peroksidāzes aktīvajā centrā. Eikosatetraēnskābe. Izejviela: prostaglandīnam PGs, prostaciklīnam PGIs, tromboksānam TXs un leikotriēnam LTs. COX sintezātora inhibitori: aspirīns, warfarīns, tailenols, paracetamols, ibuprofens.Nodarbības1.00laboratorija
7ENZĪMS alkohola dehidrogenāze ADH. B3 vitamīns hidrīda jonu H‑ tunelēšanas oxidē spirtu par aldehīdu. Hydrīda jona atraušana un protona H+ disociēšana.Nodarbības1.00laboratorija
8Šūnu membrānas lipīdu kompozītā struktūra homeostāzes koncentrāciju gradientu ģenerēšanai transportam lejup un osmozei pretēji koncentrācijas gradientam. Holesterola 0,9÷1/1 fosfolipīda attiecība cilvēka eritrocītos un transporta enzīmu loma (akvaporīni, mioglobīns, hemoglobīns, COX). Steroidogēno akūti regulējošu olbantumā saistīto lipīdu transports START un to 13 veidu domēni STARD1-13 olbaltumos.Nodarbības1.00laboratorija
9Cilvēka serum albumīns HSA homeostāzes koncentrācija asinīs 0,6 mM. HSA uzlādē 7 taukskābes ar maksimālo koncentrāciju 0,6 mM*7=4,2 mM. Ūdenī nešķīstošu hēmu, bilirubīnu, testosteronu un nešķīstoās zāles aspirīnu, varfarīnu, ibuprofēnu, indometacīnu un citas.Nodarbības1.00laboratorija
10Nukleārie androgen receptori. Minerāl-kortikoīd receptori. Cinka pirkstiņu motīvs DNS struktūru apkalpošanai.Nodarbības1.00auditorija
11Genoma HOMEOSTĀZES instrumenti DNS metil transferāzes. Metilēšanas olbaltumviela DNMT3, DNMT1, HhaI. Zn2+ jonu Medicīniskā ķīmija cinka pirkstiņu motīvs uz DNS fosfātu ribozes virknēm.Nodarbības1.00auditorija
12http://aris.gusc.lv/ChemFiles/Aquaporins/AquaPorin1.htm. Akvquaporīni šūnu membrānu transporta olbaltumvielas. Molekulu H2O, O2, NO osmoze pretēji osmolārajam koncentācijas gradientam cilvēka organismā.Nodarbības1.00laboratorija
Vērtēšana
Patstāvīgais darbs:
Individuālais un studentu darbs pāros – praktisko darbu izstrāde, atbilstoši kursa tēmām. Patstāvīga atsevišķu teorētisko kursu tēmu apguve, izmantojot mācību grāmatas vai citus avotus tai skaitā zinātniskās publikācijas. Lai izvērtētu studiju kursa kvalitāti kopumā, studentam jāaizpilda studiju kursa novērtēšanas anketa Studējošo portālā.
Vērtēšanas kritēriji:
Rakstisko risinājumu kvalitātes pārbaude praktisko nodarbību izvirzītajiem uzdevumiem, jautājumiem un problēmu risinājumiem patstāvīgo eksperimentu studiju protokolos. Rakstiski kontroldarbi prasmju un iemaņu pārbaudei. Kolokviji – apgūto teorētisko un praktisko zināšanu un prasmju pārbaude, kurā tiek apliecināta mācību materiāla izpratne. Rakstveida noslēguma eksāmens.
Gala pārbaudījums (pilna laika studijas):Eksāmens (Rakstisks)
Gala pārbaudījums (nepilna laika studijas):
Studiju rezultāti
Zināšanas:Studiju kursa apguves rezultātā students spēj izpētīt molekulas, lietojot IT tehnoloģijas: • formulēt un izskaidrot medicīniskās ķīmijas un bioķīmijas jēdzienus; • aprakstīt medicīniski ķīmisko procesu kvantitatīvās un kvalitatīvās sakarības; • novērtēt skābekļa, glikozes, CO2, asins pH, osmolārās un koncentrācijas gradienta uz membrānas nozīmi; • izskaidrot jonu kanālu veidoto membrānu potenciālu darbības principus; • pretstatīt veselīgā uzturā lietojamu dabas vielu un kaitīgo vielu iedarbību uz veselību.
Prasmes:Students pratīs analizēt bioloģiskos vielu maiņas līdzsvarus un homeostāzes stāvokļus. Pratīs novērtēt vielu apmaiņu un pārvērtības ekvivalentos daudzumos, balstoties uz olbaltumvielu enzīmu darbības mehānismiem. Spēs analizēt enzīmu uzbūves un sastāva ietekmi, lai spētu novērtēt mijiedarbību ar vidi un integrēto vielmaiņu dzīvības funkciju uzturēšanā, ko atspoguļos studentu noformētie studiju darba rezultāti laboratorijas darbu protokolu secinājumi, testi un kolokviji.
Kompetences:Students spēs pielietot iegūtās zināšanas par daudzveidīgajiem medicīniskās ķīmijas procesiem un mehānismiem un pamatprasmes novērtēt šo procesu un mehānismu funkcionalitāti, lai izdarītu kompetentus, integrētus slēdzienus par homeostāzes norisēm organismā.
Bibliogrāfija
Nr.Atsauce
Obligātā literatūra
1David L. Nelsone, Michael M. Cox. Lehninger Principles of Biochemistry. 2017. W.H. Freeman and Company, New York.
2Literature: http://aris.gusc.lv/2024MFLatBkurss.pdf; 2023. gada 36 publications
Papildu literatūra
1Biochemie des Menschen. Horn F. 8th ed., 2020.
Citi informācijas avoti
136 Publikācijas izvēlētajos Medicīniskās ķīmijas tematos 1. un 2. lapaspusē /36 Publications in selected Medicinal Chemistry topics on pages 1 and 2