Augsta riska cilvēka papilomas vīrusa tipu ģenētiskais raksturojums Ukrainā un Latvijā, lai veidotu informētu valsts politiku dzemdes kakla vēža profilakses jomā

Projekts sastāv no šādām darba pakām:

1. Retrospektīva dzemdes kakla vēža gadījumu atlase Kijivā, Ukrainā, kā arī retro- un prospektīva DKV gadījumu un augstas pakāpes dzemdes kakla bojājumu (CL) gadījumu atlase Rīgā, Latvijā, un pētījuma kohortas izveide.
2. HR HPV genotipēšana, lai izveidotu salīdzinošu epidemioloģisko “portretu” par ar HPV saistītajiem CL un DKV gadījumiem Latvijā un Ukrainā.
3. Latvijā un Ukrainā izplatīto HE HPV pilna genoma sekvencēšana (WGS), lai raksturotu tos molekulārā līmenī un sasaistītu to stabilitāti/mainību ar dzemdes kakla patoloģijām, identificētu sekvences “parakstus”, kas ir saistīti ar CL un DKV parametriem, ar mērķi izmantot tos kā molekulāros marķierus personalizētai slimības gaitas un iznākuma prognozei, kā arī uzraudzības un ārstēšanas stratēģijai.
4. Projekta rezultātu izplatīšana un ietekmes nodrošināšana, informējot starptautisko pētniecības sabiedrību, Latvijas un Ukrainas veselības iestādes un citus ieinteresētos par HPV statusu sievietēm ar dzemdes kakla bojājumiem un vēzi, demonstrējot akūtu nepieciešamību ieviest HPV vakcināciju Ukrainā un veicināt HPV vakcināciju Latvijā pusaudžu un jauniešu vidū, kā arī “catch-up” vakcināciju pieaugušajiem.
5. Latvijas un Ukrainas vadošo medicīnisko pētniecības iestāžu pētniecisko aktivitāšu saskaņošana, jauno pētnieku apmācība un karjeras veicināšana, kā arī pētniecības sadarbības stiprināšana nacionālā un starptautiskā līmenī.
6. Efektīva projekta koordinēšana un vadība, lai nodrošinātu rezultātu sasniegšanu abu komandu darbā.

Šī darba programma paredz, ka RSU komandas uzdevumi būs turpināt uzraudzīt HR HPV genotipu izplatības dinamikas izmaiņas DKV gadījumos (turpinot LZP projektu 2021/1-0484); noteikt HR HPV genotipus DKV gadījumos, ko ievācis Ukrainas partneris; salīdzināt HR HPV izplatības modeļus; apkopot un iesniegt GenBank datubāzē pilnus HR HPV genomus, kas ir izplatīti Latvijā un Ukrainā; veikt to salīdzinošo analīzi; organizēt regulāras projekta komandas tikšanās, hibrīdseminārus, virtuālo/hibrīd-konferenci par hroniskām vīrusu infekcijām un vēzi; sagatavot tēzes zinātniskajām konferencēm un izstrādāt zinātnisko publikāciju manuskriptus.

Tas ļaus izvērtēt HPV vakcinācijas ilgtermiņa efektus Latvijā, salīdzinot ar nevakcinēto populāciju Ukrainā, identificējot imūnās izvairīšanās pazīmes. Tāpat tiks noteikti slimības smaguma molekulārie paraksti ar diagnostisku/prognostisku vērtību. Projekta rezultāti pievērsīs abu valstu veselības iestāžu uzmanību nepieciešamībai atbalstīt un veicināt HPV skrīningu un vakcināciju, nostiprinot pozīciju pret HPV/pret vēža kampaņā. Projekts stiprinās pētniecības sadarbību paplašinātajā Eiropā.

Ukrainas partneris: 

R.E. Kavecka Eksperimentālās patoloģijas, onkoloģijas un radiobioloģijas institūts (IEPOR), Ukrainas Nacionālās Zinātņu akadēmija (NAS).

IEPOR komandā ir divi pieredzējuši pētnieki – projekta vadītāja Dr. habil. Elena Kašuba, vecākā zinātniece Dr. Larysa Kovalevska, kā arī divi doktoranti. Komanda strādā šūnu transformācijas jomā, tostarp vīrusu inducētās transformācijas pētījumos. Komandas locekļi ir pētījuši Epšteina–Barra vīrusa (EBV) izraisītu šūnu transformāciju un C hepatīta vīrusa (HCV) ietekmi uz aknu audzēju attīstību. Pēdējos pētījumos uzmanība pievērsta metastāžu supresora 1 (MTSS1) lomai un tā zudumam audzēju vēlīnās stadijās un metastātiskajos audos nazofaringeālās karcinomās. Komanda arī strādā pie nanodaļiņu izstrādes proteīnu un oligonukleotīdu mērķētai transportēšanai.

Galvenās publikācijas, kas saistītas ar projekta tēmu:

1. Shcherbina V, Kovalevska L, Pedachenko E, Malysheva T, Kashuba E. Comparative Analysis of the Embryonal Brain Tumors Based on Their Molecular Features. Discov Med. 2023 Oct;35(178):733-749. doi: 10.24976/Discov.Med.202335178.69. PMID: 37811612.
2. Govorov I, Attarha S, Kovalevska L, Andersson E, Kashuba E, Mints M. STK4 protein expression pattern follows different trends in endometrioid and serous endometrial adenocarcinoma upon tumor progression. Sci Rep. 2022 Dec 22;12(1):22154. doi: 10.1038/s41598-022-26391-9. PMID: 36550267; PMCID: PMC9780310.
3. Govorov I, Attarha S, Kovalevska L, Andersson E, Kashuba E, Mints M Upregulation of PKN1 as a Prognosis Biomarker for Endometrial Cancer. Cancer Control. 2022 Jan-Dec;29:10732748221094797. doi: 10.1177/10732748221094797. PMID: 35533253; PMCID: PMC9092572.
4. Kovalevska L, Golenkov O, Kulahina Y, Callender T, Sizov F, Kashuba E. A Comparative Study on the Viability of Normal and Cancerous Cells upon Irradiation with a Steady Beam of THz Rays. Life (Basel). 2022 Mar 5;12(3):376. doi: 10.3390/life12030376. PMID: 35330127; PMCID: PMC8951499.
5. Zvejniece L, Kozireva S, Rudevica Z, Leonciks A, Ehlin-Henriksson B, Kashuba E, Kholodnyuk I. Expression of the Chemokine Receptor CCR1 in Burkitt Lymphoma Cell Lines Is Linked to the CD10-Negative Cell Phenotype and Co-Expression of the EBV Latent Genes EBNA2, LMP1, and LMP2. Int J Mol Sci. 2022 Mar 22;23(7):3434. doi: 10.3390/ijms23073434. PMID: 35408790; PMCID: PMC8998437.